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\section{\texorpdfstring{Sabrina Latansio}{Sabrina Latansio}}
\label{sec:sabrina_latansio}


Bacharel em Ciências Biológicas pela UNESP, Mestre em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente pelo IBt/SMA, Doutora em Biologia Vegetal pela UNICAMP, atual Pós-doutoranda da USP. Linha de pesquisa com ênfase em ecofisiologia do uso do Carbono e Nitrogênio em plantas arbóreas de florestas e savanas. 
Contatos: salatansio@yahoo.com.br, salatansio@hotmail.com

\href{http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777506Z8}{Currículo lattes}

\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/salatansio/master_s.pdf}{Dissertação de Mestrado}

\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/salatansio/phd_thesis.pdf}{Tese de Doutorado}

\underline{\textbf{Apostilas de Introdução ao uso do R em português:}}

\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/salatansio/apostila_r_-_uerj.pdf}{Apostila UERJ}

\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/salatansio/apostila_r_-_pire.inpa.pdf}{Apostila PIRE/INPA}

\underline{\textbf{Divulgação dos Artigos publicados:}}\begin{longtable}{|l|l|l|}
\hline
\textbf{ano} & \textbf{revista} & \textbf{link} \\ 
\hline
 
2012 & Journal of Mass Spectrometry &  \href{http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jms.3100/abstract;jsessionid=0BAAF6464516F6F13595DB1A71DEE545.d02t03}{Application of MALDI-MS analysis of Rainforest} \\ 
\hline
 
2012 & Planta Medica &  \href{https://www.thieme-connect.de/DOI/DOI?10.1055/s-0032-1320659}{HT-MALDI-MS: A keystone for Brazilian biodiversity conservation} \\ 
\hline
 
2012 & Revista Biota Neotropica & \href{http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S1676-06032010000100020\&script=sci_arttext}{Fitossociologia de um Cerrado denso} \\ 
\hline
 
2010 & Journal of Plant Physiology & \href{http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0176161709004556}{Specific leaf areas of the tank bromeliad Guzmania monostachia} \\ 
\hline
 
2009 & Scientia Agricola & \href{http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S0103-90162009000400006\&script=sci_arttext}{Isotopic view of vegetation and carbon and nitrogen} \\ 
\hline
 
2008 & Revista Biociências UNITAU & \href{http://periodicos.unitau.br/ojs-2.2/index.php/biociencias/article/viewFile/561/296}{Gas exchange, vegetative development, phenology} \\ 
\hline
 
\end{longtable}





\underline{\textbf{TRABALHO FINAL}}

\textbf{PROPOSTA 1} -
Criar uma função no R que tenha como entrada/input um vasto conjunto de dados advindos de muitas espécies de plantas, com variáveis ecofisiológicas de diversas naturezas, e que seja capaz de buscar grupos funcionais possíveis entre as espécies avaliadas. Gerando gráficos/output dos prováveis grupos e suas variáveis determinantes. A idéia é que a função possa encontrar as maiores similaridades funcionais entre as espécies e agrupá-las. E se possível, que depois disso a função possa comparar os grupos criados com histogramas evolutivos que contenham informações sobre a evolução de cada espécie de planta estudada, de forma que forneça pistas e/ou possibilidades de quais atributos melhor se relacionam à história evolutiva das plantas estudadas.

\textbf{PROPOSTA 2} -
Criar uma função que se utilize de dados já gerados por modelos de previsão de deposição de nitrogênio (N) em certas regiões no mundo, e de dados ecofisiológicos sobre uso de nitrogênio em plantas arbóreas de ecossistemas diversos, e simule cenários de mudanças na composição das espécies das comunidades utilizadas no input, gerando figuras com estes cenários. A idéia é fazer previsões sobre o comportamento de espécies específicas em comunidades vegetais específicas, com base nos seus perfis de uso de N, em relação aos cenários previstos de deposição de N em áreas específicas do mundo. Seria uma forma de prever respostas de plantas à deposição de N. Por exemplo, a função seria capaz de mostrar que uma certa espécie não toleraria certo excesso de N no ambiente e apenas sobreviveria se migrasse para outra região com menor deposição, ou que esta espécie seria possivelmente extinta se tal deposição ocorresse.

\section{\texorpdfstring{Comentários}{Comentarios}}
\label{sec:comentarios}


Olá Sabrina,

As idéias são bacanas, mas muito ambiciosas. Estão mais para pacotes do CRAN que para função de curso!
Além disso, trazem complicações teóricas muito grandes, p.ex: determinar critérios objetivos para a definição de grupos funcionais é um tema polêmico e não resolvido na literatura e tampouco metodologicamente. Não fica claro tb. como fará a inclusão da história evolutiva dos grupos (ficou muito geral e esse tb. é um desafio grande).
Minha sugestão é que não se comprometa com uma proposta muito ambiciosa, com o risco de se frustar. Além disso, vamos avaliar a função pelo que vc. se comprometeu a entregar nessa proposta.
Para ser bastante conservativo, sugiro que faça apenas o inicio da idéia:
\begin{enumerate}
  \item a partir de dados de caracteres funcionais (morfologicos, fisiológicos...) criar uma matriz de similaridade (OU DISTÂNCIA) entre as espécies e devolver um gráfico com um cluster e a matriz, sem se comprometer com a definição dos grupos funcionais nesse momento.
\end{enumerate}


Sugiro também que use o indice de Gower que permite a inclusão de dados de diferentes naturezas...
Veja o livro do Legendre (Numerical Ecology) ou google it (,,Gower similarity index")! Veja tb. a função hclust() para grafico de cluster hierarquico.
Não esqueça: MODIFIQUE A PROPOSTA PARA QUE A AVALIAÇÃO SEJA FEITA A PARTIR DESSA SIMPLIFICAÇÃO

Bom trabalho! 
 --- \emph{\href{mailto:adalardo@usp.br}{Alexandre Adalardo de Oliveira} 2013/03/25 10:11}

\end{document}
