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| //Também conhecida como Brabuleta (ou Brabs)!// | //Também conhecida como Brabuleta (ou Brabs)!// | ||
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| Os ritmos biológicos estão amplamente distribuídos entre os seres vivos conhecidos, sendo observados tanto em seres unicelulares quanto em multicelulares. Consistem em __flutuações cíclicas de variáveis biológicas nos mais diversos níveis de organização__, desde a expressão de um gene, a secreção rítmica de um hormônio, o comportamento (como o padrão de alternância entre sono e vigília em animais) ao nível populacional (como os padrões de migrações sazonais). Como resultado, tem-se a __distribuição temporal__ das diversas funções biológicas ao longo do dia e da noite, do mês ou do ano. A figura abaixo traz um exemplo de um ritmo de movimentação foliar observado em //Phaseolus multiflorus//. [Mais informações [[http://www.biologydiscussion.com/plants/circadian-rhythms/circadian-rhythms-in-plants-with-diagram/23630|aqui!]]]: | Os ritmos biológicos estão amplamente distribuídos entre os seres vivos conhecidos, sendo observados tanto em seres unicelulares quanto em multicelulares. Consistem em __flutuações cíclicas de variáveis biológicas nos mais diversos níveis de organização__, desde a expressão de um gene, a secreção rítmica de um hormônio, o comportamento (como o padrão de alternância entre sono e vigília em animais) ao nível populacional (como os padrões de migrações sazonais). Como resultado, tem-se a __distribuição temporal__ das diversas funções biológicas ao longo do dia e da noite, do mês ou do ano. A figura abaixo traz um exemplo de um ritmo de movimentação foliar observado em //Phaseolus multiflorus//. [Mais informações [[http://www.biologydiscussion.com/plants/circadian-rhythms/circadian-rhythms-in-plants-with-diagram/23630|aqui!]]]: | ||
| - | {{ :bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:ritmo_planta.jpg?nolink&500 |}} | + | {{ :01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:ritmo_planta.jpg?nolink&500 |}} |
| Essa distribuição temporal das funções muitas vezes acontece de forma associada às variações ambientais, como de dia e noite, quente e frio. No entanto, essa relação nem sempre é obrigatória! É possível que um ritmo biológico se mantenha mesmo que todas as variações do ambiente sumam. Por esse motivo, os estudos dos ritmos biológicos, feitos pela chamada Cronobiologia, __acontecem associados a diferentes condições ambientais__. | Essa distribuição temporal das funções muitas vezes acontece de forma associada às variações ambientais, como de dia e noite, quente e frio. No entanto, essa relação nem sempre é obrigatória! É possível que um ritmo biológico se mantenha mesmo que todas as variações do ambiente sumam. Por esse motivo, os estudos dos ritmos biológicos, feitos pela chamada Cronobiologia, __acontecem associados a diferentes condições ambientais__. | ||
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| Uma ferramenta muito utilizada para analisar padrões de ritmos na Cronobiologia é o __actograma__, que consiste num empilhamento das atividades registradas dia a dia, com o objetivo de permitir a visualização de padrões na escala diária. Para facilitar ainda mais essa visualização, geralmente são feitos na forma de dupla. Imagine que você tem registros da movimentação de um animal durante 120 horas corridas, e que, se você desenhasse essa movimentação numa fita, ela estaria marcado em rosa como na figura abaixo. Para construir um actograma, basta "cortar" sua fita em pedaços de 24 horas e colocá-las empilhadas em sequência, indo do dia A ao dia E. Por fim, basta duplicar essas fitas e alinhá-las com sua vizinha seguinte para formar um actograma duplo, criando pares AB, BC, CD e DE. como consequência dessa cópia deslocada, a primeira e a última linha do actograma ficam sem par. | Uma ferramenta muito utilizada para analisar padrões de ritmos na Cronobiologia é o __actograma__, que consiste num empilhamento das atividades registradas dia a dia, com o objetivo de permitir a visualização de padrões na escala diária. Para facilitar ainda mais essa visualização, geralmente são feitos na forma de dupla. Imagine que você tem registros da movimentação de um animal durante 120 horas corridas, e que, se você desenhasse essa movimentação numa fita, ela estaria marcado em rosa como na figura abaixo. Para construir um actograma, basta "cortar" sua fita em pedaços de 24 horas e colocá-las empilhadas em sequência, indo do dia A ao dia E. Por fim, basta duplicar essas fitas e alinhá-las com sua vizinha seguinte para formar um actograma duplo, criando pares AB, BC, CD e DE. como consequência dessa cópia deslocada, a primeira e a última linha do actograma ficam sem par. | ||
| - | {{ :bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:actograma.png?nolink&500 |}} | + | {{ :01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:actograma.png?nolink&500 |}} |
| Um exemplo mais real de um actograma, para diferentes condições de claro-escuro ambiental, pode ser visto [[https://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/170795/|Neste trabalho com camundongos]] em que áreas cinzas do gráfico são utilizadas para sinalizar os momentos de escuro, enquanto as áreas brancas sinalizam os momentos de claro. As demarcações em preto sinalizam os momentos de atividade do camundongo, andando na roda: | Um exemplo mais real de um actograma, para diferentes condições de claro-escuro ambiental, pode ser visto [[https://www.hindawi.com/journals/bmri/2014/170795/|Neste trabalho com camundongos]] em que áreas cinzas do gráfico são utilizadas para sinalizar os momentos de escuro, enquanto as áreas brancas sinalizam os momentos de claro. As demarcações em preto sinalizam os momentos de atividade do camundongo, andando na roda: | ||
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| Como esta é uma ferramenta visual muito utilizada na análise dos ritmos biológicos, ao mesmo tempo em que não é disponibilizada por nenhum programa gratuito, minha proposta é desenvolver uma função para plotagem de actogramas a partir de dados de ritmos biológicos. | Como esta é uma ferramenta visual muito utilizada na análise dos ritmos biológicos, ao mesmo tempo em que não é disponibilizada por nenhum programa gratuito, minha proposta é desenvolver uma função para plotagem de actogramas a partir de dados de ritmos biológicos. | ||
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| Quando se trata de qualquer estudo em Biologia, conhecer o ciclo de viva de uma espécie de interesse parece ser um dos primeiros passos antes de aprofundar qualquer investigação. Estudos demográficos, que monitoram, por exemplo, sobrevivência, mortalidade e fecundidade de populações nos permitem fazer previsões e inferências temporais. Além disso, se tornam uma ferramenta para entender efeitos externos, como de doenças ou de alterações ambientais. Esses monitoramentos demográficos podem ser feitos por meio das chamadas __tabelas de vida__. Um exemplo simplificado pode ser visto na [[http://www.macmillanhighered.com/BrainHoney/Resource/6716/digital_first_content/trunk/test/hillis2e/hillis2e_ch42_4.html|tabela]] a seguir, que traz a contabilização de sobrevivência e fecundidade de pássaros numa ilha, tanto em anos de chuva como de seca: | Quando se trata de qualquer estudo em Biologia, conhecer o ciclo de viva de uma espécie de interesse parece ser um dos primeiros passos antes de aprofundar qualquer investigação. Estudos demográficos, que monitoram, por exemplo, sobrevivência, mortalidade e fecundidade de populações nos permitem fazer previsões e inferências temporais. Além disso, se tornam uma ferramenta para entender efeitos externos, como de doenças ou de alterações ambientais. Esses monitoramentos demográficos podem ser feitos por meio das chamadas __tabelas de vida__. Um exemplo simplificado pode ser visto na [[http://www.macmillanhighered.com/BrainHoney/Resource/6716/digital_first_content/trunk/test/hillis2e/hillis2e_ch42_4.html|tabela]] a seguir, que traz a contabilização de sobrevivência e fecundidade de pássaros numa ilha, tanto em anos de chuva como de seca: | ||
| - | {{ :bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:tablela_passaros.png?nolink&450 |}} | + | {{ :01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:tablela_passaros.png?nolink&450 |}} |
| As tabelas de vida podem ser feitas de duas formas: | As tabelas de vida podem ser feitas de duas formas: | ||
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| * Quando observamos indivíduos de coortes distintas e que coexistem num mesmo período, sendo capazes de diferenciar suas idades. Essa é a chamada __Tabela de vida estática (ou de tempo específico)__. | * Quando observamos indivíduos de coortes distintas e que coexistem num mesmo período, sendo capazes de diferenciar suas idades. Essa é a chamada __Tabela de vida estática (ou de tempo específico)__. | ||
| - | {{ :bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:tabela_tipos.png?nolink&400 |}} | + | {{ :01_curso_atual:alunos:trabalho_final:beatriz.foganholi.fernandes:tabela_tipos.png?nolink&400 |}} |
| Como esta é uma ferramenta que pode ter uso bastante amplo nas diferentes áreas da biologia - como em conhecer sua espécie de estudo, investigar efeitos ambientais, acompanhar efeitos de medicamentos ou puramente auxiliar em planejamentos metodológicos -, minha proposta é desenvolver uma função que retorne uma tabela de vida completa a partir da escolha do usuário, além de criar gráficos para visualização dos dados de interesse e de curvas demográficas deles derivadas. | Como esta é uma ferramenta que pode ter uso bastante amplo nas diferentes áreas da biologia - como em conhecer sua espécie de estudo, investigar efeitos ambientais, acompanhar efeitos de medicamentos ou puramente auxiliar em planejamentos metodológicos -, minha proposta é desenvolver uma função que retorne uma tabela de vida completa a partir da escolha do usuário, além de criar gráficos para visualização dos dados de interesse e de curvas demográficas deles derivadas. | ||
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